股权变更纳税流程：
1、首先，确定纳税日期，一般为上个月末；
2、确定纳税所属期间财务报表中的留存收益、所有者权益、固定资产等；
3. 财务报表确认后我们就可以申报新老股东的印花税和个人所得税了，注意印花税是0.05%，个人所得税是20%；
4、缴纳印花税，您可以通过上海税务局电子税务所以自然人身份登录，点击印花税征收即可完成申报；
5、缴纳个人所得税时，只能通过企业扣缴端申报，不能以个人名义申报个人所得税；
6、缴纳印花税和个人所得税前，一定要确定股权转让的价格，如果价格低于市场价格或者税务局不同意，就不要先缴税，因为这会涉及到不同的纳税额度，而且需要退税，而且退税流程和周期较长。
7.所有提交的材料无误后，预计三个工作日内会出完税证明，拿到完税证明就可以开始工商局股东变更了！！
印花税（0.05%）及个人所得税（20%）申报流程：
1、新旧股东申报印花税时，应注意新股东为受让方，旧股东为转让方，并按照“财产转让资料”、“股权转让资料”和“实际应纳税额”填写申报，目前小规模纳税人可享受50%的印花税减免。
2、新股东无需申报个人所得税，老股东只需按照“财产转让所得”申报个人所得税。切记：股权转让金额不能明显偏低或与市场不一致。
公司股东变更所需文件：
1.《公司变更登记申请表》；
2、公司章程修改稿（全体股东签字并加盖公章）；
3、股东会决议（全体股东签字并加盖公章）；
4、公司营业执照原件；
5、全体股东的身份证复印件（需提供原件以供核对）；
6、股权转让协议原件（明确股权由谁转让给谁，股权、债权、债务一并转让，并由转让方和受让方签字）。
深圳公司股东变更流程：
1、代理人凭个人U盾或数字证书即可网上预约；
2、到工商局窗口领取纸质《企业变更（备案）申请表》；
3、填写变更表、股权转让协议、经股东签字并加盖行政印章的公司章程修正案。公司章程修正案由公司法定代表人签字并加盖行政印章：
4、负责人按预约时间到工商局窗口递交材料；
5、收到变更通知（若法人股权发生变更，需更换营业执照）；
6.去税务局变更信息；
7.去银行变更股东资料；